食品检测可分为两大项，一是检测产品的品质项目；二是检测产品的卫生项目，这一类项目的检测相对难度大,投资高。卫生项目包括微生物，添加剂，有害元素，农残留，兽残留，毒素等。
微生物：
建微生物实验室要按照生物实验室设备及装备规范标准要求进行布局。必要的设备有洁净台，培养箱，高压灭菌锅，电炉等，其它设备则根据具体检测项目配置。
添加剂和有害元素：
有一部分项目可以用化学法，但想满足现在国际的食品卫生要求，应该购置气相色谱-氢火焰检测器，液相色谱-紫外/可见光检测器,原子吸收仪-石墨炉检测器，原子荧光仪等。
残留农药：
检测残留农药气相色谱是不能少的。检测有机氯农药，需配电子俘获ECD检测器；检测有机磷农药，需配火焰光度FPD检测器或氮磷NPD检测器。现在农残检测的项目越来越多，为提高通用性，建议配置毛细管柱分流/不分流进样口，安装毛细管色谱柱。出口食品加工企业为了把好生产原料和产品质量关，可以配置气相色谱-质谱仪。
残留兽药：
若进行残留兽药的检测，项目不多且批次多，可以配置酶联免疫仪。对于有一定规模的出口食品企业，最好配置一台液相色谱-串联质谱仪。
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